Yapıların tapu işlemleri de bu süreçte gerçekleştiriliyor. Ancak kentsel dönüşümde tapu masrafı ödenmiyor. Tapu işlemleri, riskli yapıların yıkımı ve yerine yeni yapıların inşası nedeniyle kamu yararı taşıdığından dolayı, tapu harcı alınmıyor. Bu nedenle kentsel dönüşüm sürecinde tapu masrafı gibi bir masraf ödenmiyor. kentsel dönüşümde tapu masrafı bulunmuyor. Bu tür işlemlerde, noter harcı, tapu harcı, belediyelerce alınan harçlar, damga vergisi, veraset ve intikal vergisi, döner sermaye ücreti ve diğer ücretlerden muafiyet sağlanıyor. Ayrıca, kentsel dönüşüm sürecinde kullanılan krediler için alınacak lehe alınacak paralar da banka ve sigorta muameleleri vergisinden muaf tutuluyor.
Kentsel dönüşümde tapu masrafı alınmaz. 6306 Sayılı Afet Riski Altındaki Alanların Dönüştürülmesi Hakkında Kanun’un uygulama yönetmeliği uyarınca, kentsel dönüşüm kapsamında yapılacak işlem, sözleşme, devir ve tesciller ile uygulamalar noter harcı, tapu harcı, belediyelerce alınan harçlar, damga vergisi, veraset ve intikal vergisi, döner sermaye ücreti ve diğer ücretlerden muaf tutulur.
Ayrıca, mevcut yapıların İmar Mevzuatına uygun olup olmadığına bakılmaksızın vergi, harç ve ücret muafiyetleri uygulanır. Ancak, riskli alanlarda gerçek kişiler veya özel hukuk tüzel kişilerince, İlgili kurum adına değil de kendi adlarına uygulama yapıldığında, riskli alanlardaki yapıların mevcut alanları için daha önce belediyelerce alınan harç ve ücretlere ilave olarak, sadece kullanım maksadı değişiklikleri ile yapı alanındaki artışlar için hesaplanan harç ve ücret farkları alınır.
